为什么判断两个物种亲缘关系的时候要比对高度保守的序列（16sRNA）？

保守度高的序列在不同生物中应该都很相似啊，这样就不能区别不同物种的啊？

我来帮他解答

2012-6-7 22:25

满意回答保守度高指的是在进化过程中这段序列的变化很小，不是说各物种的序列相似性高。 另外，16SrRNA对应的DNA序列适用于原核生物，如果是真核生物，应该是18S。

追问

哦，谢谢。我明白“保守”的含义了。 但是，这样问题还存在：进化过程中变化小就体现不出一个祖先进化出两个不同物种的区别了啊？

回答

以细菌为例，一般来说，当两株菌16SrRNA的序列相似性在97%（有的也说是97.5%）以下时，我们认为这是两种菌，即两个物种。一种菌，它在进化过程中16SrRNA的序列变化如果达到了3%，基本上就认为变异成了一个新的物种。因此，如果两株菌16SrRNA的序列相似性大于97%，即使不是完全相同，也可以认为是一个物种。当然也有例外，比如16S的相似性很高，但做完DNA杂交之后，相似性在70%以下，也认为是不同的物种。 就是因为保守，所以才选择做为物种鉴定的依据，不然每传一代都会发生变异，那么就不能代表这个物种了。就你的问题来说，一个祖先如果它的基因变异达不到一定比例，就不能算是两个物种。 希望能解释清楚，如果有问题请继续追问，我会尽快回答。

追问

谢谢任羿！解释的好清楚！ 还想再问一个问题：是不是16S rRNA 基因序列的相似性 就和对于动物来说的生殖隔离一样，只不过是人为选定的一种进化分类的标准？ 之所以选它作为标准是因为人们发现以它为标准的分类结果同人们对表型的一些特征所做出的分类结果比较吻合？

回答

对原核生物来说是这样的。因为对细菌来说，它的特征无非就是菌落形态，菌的形态，底物利用，生理生化反应，生长因子等等这些，同一种菌的不同菌株都有可能出现不同的生理生化反应，因此只看表型特征是不够的。至于16S怎么就被当成鉴定菌种的标准，可能是长久以来的科学家试过各种各样的特征来进行区分，最后发现只有16S能够很好地区分不同的菌种，所以现在就都采用16S了。

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